他立刻下令在鸭绿江和平壤之间的清川江上游修筑堤坝蓄水。
而当来护儿率领隋军到达清川江时，见江水很浅，士兵进入水中只齐腰深。
于是，来护儿便下令隋军涉水过江。
正当隋朝军队过江之时，乙支文德下令开闸放水。正在过河的十余万隋军顿时便被汹涌而来的洪水冲走淹死。
乙支文德随后便率领高丽军，向被困于洪水中的隋朝军队发动了猛烈的进攻。
由于他准备充分，早备齐了战船和小舟。在船上的高丽士兵箭如雨下，将还在洪水中挣扎的隋军士兵一一射死，只有来护儿侥幸逃脱了。
最后仅有两千七百名水性较好的士兵，泅水游过了鸭绿江，返回了大军之中。
而这时，原本准备展开进攻的隋军主力也陷入了恐慌之中。因为在辽河东岸的大营中流行起了瘟疫。许多士兵和民夫都病倒了，甚至包括一些驻守的将领。而且瘟疫传播的速度也很快。而此处是隋军的粮草辎重存放地，那里发生了严重的瘟疫，将使前线隋军的进攻不可避免地受到影响。
在这种情况下，杨广只得放弃了原来的南北夹击高丽军的计划。
他下令马上召开会议，将军中所有高级将领和随行大臣皆召到大帐之中，商讨隋军下一步的行动方案。
“目前的情况大家都知道了，杨义臣和来护儿这两个老匹夫辜负了朕对他们的期望，带领三十万大军突袭高丽首都平壤，竟然也能闹个全军覆没。实在是罪该万死！将朕远征高丽的大计毁于一旦！”杨广怒不可遏地大声吼道。
身为皇帝，竟然也曝了一次粗口，足见他实在是愤怒到了极点。
之前他是想过利用远征高丽辗除关陇门阀在军中的势力，但他却绝没有想过要把这场战争打输。如果出动百万大军，数百万民夫，运送了上千万石粮食，最后还闹个惨败收场。这会严重动摇他的威信，那些原本就对他有些不服的世家门阀，更会蠢蠢欲动。
裴矩见状，连忙上前一步，躬身行礼道：“陛下请息怒！眼下虽然我军失利，但高丽军也伤亡惨重，据探子回报，乙文支德身边的兵士也仅有不到三万人。他们也仅仅只能固守坚城而已，绝无可能向我军反攻。眼下其实最主要的，还是如何应付这场在军营中流行的瘟疫，否则，恐怕过不了半月，我军大半士兵就会染病死去，届时高丽军如再趁火打劫，只怕……”
他最后一句话虽然没说，但人人都知道，真若高丽军在隋军因瘟疫崩溃之时，掩杀过来，那隋军即使不闹个全军覆没，恐怕也没多少人能回得了中原了。
杨广听闻之后，也微微色变，于是便转过头向虞世基问道：“虞大人，你可问过太医，这瘟疫能治否？”
虞世基忙挤出一丝难看的笑容道：“回陛下，老臣已问过从后方大营中回来的几位太医，他们均对这瘟疫束手无策。虽然首席御医刘文峰还未回来，但恐怕他也没法医治。而据一位老太医称，此病恐怕只有药王孙思邈才能医治……”
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